Deoarece cauzele pot fi diverse alte afectiuni (neurologice, alergice, patologice, afectiuni genetice sau ale sistemului imunitar etc.), tratamentul depinde de cauza glosodiniei.
De exemplu, daca glosodinia este cauzata de un neurinom, atunci va trebui tratat neurinomul, glosodinia fiind doar un simptom al altei afectiuni.
Daca afectiunea principala va fi tratata, atunci si glosodinia poate sa dispara in urma ameliorarii afectiunii cauzante.
Ceea ce este dificil de stabilit, insa, este cauza.Asta deoarece nu se cunosc pe deplin cauzele si se iau in calcul mult prea multe afectiuni.De cele mai multe ori, pentru a incepe de undeva, din moment ce se ia prin eliminare, pacientii sunt indrumati catre neurologie in prima instanta.